단일세포 공간 전사체학 기반의 리보핵단백질(RNP) 복합체 국소화 프로파일링 기법

단일세포 공간 전사체학은 특정 세포 내 위치에 따라 발현되는 유전자들의 공간적 정보를 제공하며, 이를 확장하여 리보핵단백질(RNP) 복합체의 세포 내 정밀한 국소화 정보를 얻고자 한다.

분석 방법론

• FISH 및 in situ Hybridization (ISH)과의 융합: 특정 mRNA 또는 snRNA 타겟에 대한 FISH 프로브를 사용하여 전사체 이미지 위에 RNP 구성 성분을 직접 매핑한다.
• 단백질 면역형광염색(IF)과의 조합: Cryo-EM 또는 고해상도 confocal microscopy 기술을 적용하여 주요 RBP의 세포 내 위치를 확인하고, 이는 전사체 데이터의 공간적 맥락과 결합된다.

이러한 통합 분석은 신호전달 경로상의 RNP 활동이 어느 세포소기관(예: 리보솜, 핵)에서 어떻게 이루어지는지에 대한 분자적 증거를 제시하며, mRNA 안정성 및 번역 효율 조절 기전을 심층적으로 규명하는 데 필수적이다.